• Descripció

La Bioinformàtica neix, fa més de dues dècades, per la necessitat dels biòlegs d'analitzar dades i simular processos complexos per testar hipòtesis. La seva gran importància, no obstant això, sorgeix després de la seqüenciació completa dels primers genomes i la generalització de tècniques "high-throughput" . En els darrers anys, el ritme d'obtenció de dades és tan elevat que les eines bioinformàtiques han esdevingut imprescindibles per la gestió d'aquestes dades.

D'aquesta manera, cada dia més biòlegs són usuaris de la bioinformática. Alguns no troben les eines que precisen en els seus estudis i han d'intentar generar-les ells mateixos o recórrer a un informàtic amb el qual treballar en estreta col·laboració.

És evident que per al desenvolupament d'eines bioinformàtiques han de dominar-se els principis de la informàtica. No obstant, això no hauria de ser suficient. Un/a bon/a bioinformàtic/a hauria de posseir a més una bona base en biologia. Això contribuirà a la seva millor comprensió de les necessitats de l'usuari d'aquelles aplicacions que desenvolupi. A més, li oferirà autonomia en la decisió de quins projectes ha d'abordar per ser més susceptibles d'interès per a la comunitat científica a la qual van dirigits.

Vídeo de presentació de l'assignatura

• Objectius i competències

Objectius de l'assignatura:

• Conèixer quines són les característiques bàsiques d'un organisme viu i les diferències entre cèl·lules procariotes i eucariotes.
• Conèixer la química i estructura de les molècules essencials per al funcionament de les cèl·lules.
  Comprendre com s'emmagatzema la informació hereditària en les cèl·lules i com es transmet a la generació següent.
• Comprendre els passos de la síntesi proteïca.
• Comprendre els processos d'evolució molecular (mutació, selecció, deriva).
• Entendre com podem mesurar la taxa de canvi en diferents seqüències relacionades amb un avantpassat comú.
• Reconstruir arbres evolutius i interpretar-los.
• Adquirir coneixement biològic des de l'escala cel·lular a la d'organisme, amb una visió interdisciplinària i especial èmfasi en aplicacions biomèdiques.

Competències que es treballen en l'assignatura:

Competències transversals

CT2- Capacitat per a la comunicació oral i escrita per a la vida acadèmica i professional.
CT5- Capacitat per a la comprensió, l'anàlisi i la síntesi.

Competències específiques

CE1- Comprendre les bases moleculars i les tècniques experimentals estàndards més comunes en les recerques òmiques (genòmica, transcriptòmica, proteòmica, metabolòmica, interactòmica, etc).
CE8- Conèixer les principals bases de dades biològiques públiques i saber com explotar la informació.
CE12- Ús avançat de les eines de programari estadístic adequades per als diferents problemes de modelització i anàlisi de dades.
CE13- Ús avançat de les aplicacions informàtiques d'ús més freqüent en bioinformàtica i bioestadística.
CE15- Saber utilitzar algorismes d'alineació de seqüències i de generació d'arbres evolutius, així com mètodes de seqüenciació i predicció.

• Continguts

L'assignatura s'estructura en les següents 5 Unitat:

1. Que és la vida i que la caracteritza?
   
   1. Organismes i cèl·lules
   2. Les molècules de la vida
   3. Transmissió de la informació genètica
2. De gens a proteïnes
   1. Trascripció
   2. Processament de l'ARN
   3. Traducció
   4. Regulació de l'expressió gènica
3. Gens i genomes
   1. Genètica clàssica: Lleis de Mendel
   2. El gen a nivell molecular
   3. Lligament i Herència lligada al sexe
   4. Altres tipus d'Herència biològica
   5. Genomes
   6. Seqüenciació de genomes
   7. Genòmica comparada
4. Variació i Evolució
   1. Mutació
   2. La teoria de la selecció natural de Darwin
   3. Deriva genètica
   4. Genètica de poblacions
5. Evolució de seqüències
   1. Teoria neutralista de Kimura
   2. Models de substitució nucleotídica
   3. Polimorfisme nucleotídic
   4. Mètodes de reconstrucció filogenètica

• Consulta dels recursos d'aprenentatge de la UOC per a l'assignatura

• Informacions sobre l'avaluació a la UOC

A la UOC, l'avaluació generalment és virtual. S'estructura entorn de l'avaluació contínua, que inclou diferents activitats o reptes; l'avaluació final, que es porta a terme mitjançant proves o exàmens, i el treball final de la titulació.

Les activitats o proves d'avaluació poden ser escrites i/o audiovisuals, amb preguntes aleatòries, proves orals síncrones o asíncrones, etc., d'acord amb el que decideixi cada equip docent. Els treballs finals representen el tancament d'un procés formatiu que implica la realització d'un treball original i tutoritzat que té com a objectiu demostrar l'adquisició competencial feta al llarg del programa.

Per verificar la identitat de l'estudiant i l'autoria de les proves d'avaluació, la UOC es reserva la potestat d'aplicar diferents sistemes de reconeixement de la identitat i de detecció del plagi. Amb aquest objectiu, la UOC pot dur a terme enregistrament audiovisual o fer servir mètodes o tècniques de supervisió durant l'execució de qualsevol activitat acadèmica.

Així mateix, la UOC pot exigir a l'estudiant l'ús de dispositius electrònics (micròfons, càmeres o altres eines) o programari específic durant l'avaluació. És responsabilitat de l'estudiant assegurar que aquests dispositius funcionen correctament.

El procés d'avaluació es fonamenta en el treball personal de l'estudiant i pressuposa l'autenticitat de l'autoria i l'originalitat de les activitats acadèmiques. Al web sobre integritat acadèmica i plagi de la UOC hi ha més informació respecte d'aquesta qüestió.

La manca d'autenticitat en l'autoria o d'originalitat de les proves d'avaluació; la còpia o el plagi; la suplantació d'identitat; l'acceptació o l'obtenció de qualsevol activitat acadèmica a canvi d'una contraprestació o no; la col·laboració, l'encobriment o l'afavoriment de la còpia, o l'ús de material, programari o dispositius no autoritzats en el pla docent o l'enunciat de l'activitat acadèmica, inclosa la intel·ligència artificial i la traducció automàtica, entre altres, són conductes irregulars en l'avaluació que poden tenir conseqüències acadèmiques i disciplinàries greus.

Aquestes conductes irregulars poden comportar el suspens (D/0) en les activitats avaluables que es defineixin en el pla docent -incloses les proves finals- o en la qualificació final de l'assignatura, sigui perquè s'han utilitzat materials, programari o dispositius no autoritzats durant les proves (com l'ús d'intel·ligència artificial no permesa, xarxes socials o cercadors d'informació a internet), perquè s'han copiat fragments de text d'una font externa (internet, apunts, llibres, articles, treballs o proves d'altres estudiants, etc.) sense la citació corresponent, per la compravenda d'activitats acadèmiques, o perquè s'ha dut a terme qualsevol altra conducta irregular.

Així mateix, i d'acord amb la normativa acadèmica, les conductes irregulars en l'avaluació també poden donar lloc a la incoació d'un procediment disciplinari i a l'aplicació, si escau, de la sanció que correspongui, de conformitat amb el que estableix la normativa de convivència de la UOC.

En el marc del procés d'avaluació, la UOC es reserva la potestat de:

• Sol·licitar a l'estudiant que acrediti la seva identitat segons el que estableix la normativa acadèmica.
• Sol·licitar a l'estudiant que acrediti l'autoria del seu treball al llarg de tot el procés d'avaluació, tant en l'avaluació contínua com en l'avaluació final, per mitjà d'una entrevista oral síncrona, que pot ser objecte d'enregistrament audiovisual, o pels mitjans que estableixi la Universitat. Aquests mitjans tenen l'objectiu de verificar els coneixements i les competències que garanteixin la identitat de l'estudiant. Si no és possible garantir que l'estudiant és l'autor de la prova, aquesta pot ser qualificada amb una D, en el cas de l'avaluació contínua, o amb un suspens, en el cas de l'avaluació final.

Intel·ligència artificial en el marc de l'avaluació

La UOC reconeix el valor i el potencial de la intel·ligència artificial (IA) en l'àmbit educatiu, alhora que posa de manifest els riscos que comporta si no s'utilitza de manera ètica, crítica i responsable. En aquest sentit, en cada activitat d'avaluació s'informarà l'estudiantat sobre les eines i els recursos d'IA que es poden utilitzar i en quines condicions. Per la seva banda, l'estudiantat es compromet a seguir les indicacions de la UOC a l'hora de dur a terme les activitats d'avaluació i de citar les eines utilitzades i, concretament, a identificar els textos o les imatges generats per sistemes d'IA, els quals no podrà presentar com si fossin propis.

Amb relació a fer servir o no la IA per resoldre una activitat, l'enunciat de les activitats d'avaluació indica les limitacions en l'ús d'aquestes eines. Cal tenir en compte que fer-les servir de manera inadequada, com ara en activitats en què no estan permeses o no citar-les en les activitats en què sí que ho estan, es pot considerar una conducta irregular en l'avaluació. En cas de dubte, es recomana que, abans de lliurar l'activitat, es faci arribar una consulta al professorat col·laborador de l'aula.

• Consulta del model d'avaluació